2024年度企業(yè)所得稅匯算清繳正在進行中，跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)注意啦，根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于優(yōu)化企業(yè)所得稅年度納稅申報表的公告》（國家稅務(wù)總局公告2025年第1號），總分機構(gòu)分?jǐn)偠惪钣嬎惴椒ㄓ凶兓?，跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)年度分?jǐn)偲髽I(yè)所得稅明細(xì)表》（A109000）及《企業(yè)所得稅匯總納稅分支機構(gòu)所得稅分配表》（A109010）的表樣和填報說明有調(diào)整！我們梳理了一些熱點問題，希望能幫助您合規(guī)納稅↓
一、總分機構(gòu)分?jǐn)偠惪钣嬎惴椒ㄓ惺裁醋兓?/span>
按照調(diào)整后的規(guī)則，企業(yè)先對全年應(yīng)納稅款進行分?jǐn)?，再由總、分機構(gòu)分別抵減其已分?jǐn)傤A(yù)繳稅款，并計算本年應(yīng)補退稅金額。
【案例】甲公司是2023年在北京市注冊成立的企業(yè)，不屬于小型微利企業(yè)。甲公司分別在山東省、天津市、河北省設(shè)立了分支機構(gòu)A、B、C。2024年，甲企業(yè)全年預(yù)繳了250萬元，其中，總機構(gòu)預(yù)繳了125萬元，A、B和C按照50％、30％、20％的分?jǐn)偙壤?，分別預(yù)繳了62.5萬元、37.5萬元、25萬元。甲公司2024年度匯繳應(yīng)納稅額300萬元，并發(fā)現(xiàn)分支機構(gòu)A、B三因素填寫錯誤，A的分配比例是30％，B的分配比例是50％。
（一）原計算方法第一步，整體計算企業(yè)本年應(yīng)補（退）稅額。
甲企業(yè)應(yīng)補（退）稅額：300－250＝50（萬元）。
第二步，根據(jù)分?jǐn)偙壤謩e計算總分機構(gòu)應(yīng)補退稅額。
總機構(gòu)應(yīng)補（退）稅額：50×50％＝25（萬元）；
分支機構(gòu)A應(yīng)補（退）稅額：50×50％×30％＝7.5（萬元）；
分支機構(gòu)B應(yīng)補（退）稅額：50×50％×50％＝12.5（萬元）；
分支機構(gòu)C應(yīng)補（退）稅額：50×50％×20％＝5（萬元）。
（二）新計算方法
第一步，根據(jù)分?jǐn)偙壤嬎憧偡謾C構(gòu)全年實際應(yīng)納所得稅額。
甲企業(yè)：300萬元總機構(gòu)：300×50％＝150（萬元）；
分支機構(gòu)A：300×50％×30％＝45（萬元）；
分支機構(gòu)B：300×50％×50％＝75（萬元）；
分支機構(gòu)C：300×50％×20％＝30（萬元）。
第二步，計算總分機構(gòu)分?jǐn)倯?yīng)補（退）所得稅額。
總機構(gòu)應(yīng)補（退）稅額：150－125＝25（萬元）；
分支機構(gòu)A應(yīng)補（退）稅額：45－62.5＝－17.5（萬元）；
分支機構(gòu)B應(yīng)補（退）稅額：75－37.5＝37.5（萬元）；
分支機構(gòu)C應(yīng)補（退）稅額：30－25＝5（萬元）。
| 分支機構(gòu)名稱 | 分支機構(gòu)分?jǐn)偙壤?/span> | 應(yīng)補（退）所得稅額 | ||
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預(yù)繳 |
匯繳 | 原計算方法 | 新計算方法 | |
| 分支機構(gòu)A | 50% | 30% | 7.5萬元 | -17.5萬元 |
| 分支機構(gòu)B | 30% | 50% | 12.5萬元 | 37.5萬元 |
| 分支機構(gòu)C | 20% | 20% | 5萬元 | 5萬元 |
| 合計 | 100% | 100% | 25萬元 | 25萬元 |
需要說明的是，匯總納稅企業(yè)如果不存在分?jǐn)偠惪钣嬎悴粶?zhǔn)確的情形，無論按原計算方法，還是按新計算方法，結(jié)果都是一樣的。但是，若匯總納稅企業(yè)預(yù)繳環(huán)節(jié)未準(zhǔn)確計算分?jǐn)偠惪睿掠嬎惴椒赏ㄟ^全量分?jǐn)偡绞?，對全年分?jǐn)偠惪钪匦掠嬎?，實現(xiàn)多退少補。
案例中，由于分支機構(gòu)A和分支機構(gòu)B在預(yù)繳環(huán)節(jié)分?jǐn)偠惪畈粶?zhǔn)確，按新計算方法計算后，分支機構(gòu)A在匯算清繳時應(yīng)退稅17.5萬元，分支機構(gòu)B應(yīng)補稅37.5萬元，實現(xiàn)了對預(yù)繳未準(zhǔn)確分?jǐn)偠惪畹恼{(diào)整；由于分支機構(gòu)C不存在分?jǐn)偠惪畈粶?zhǔn)確的情形，無論按哪種方法計算，分支機構(gòu)C在匯算清繳時均應(yīng)補稅5萬元。
二、所有的二級分支機構(gòu)都需要就地分?jǐn)偲髽I(yè)所得稅嗎？
二級分支機構(gòu)，是指匯總納稅企業(yè)依法設(shè)立并領(lǐng)取非法人營業(yè)執(zhí)照（登記證書），且總機構(gòu)對其財務(wù)、業(yè)務(wù)、人員等直接進行統(tǒng)一核算和管理的分支機構(gòu)?？倷C構(gòu)和具有主體生產(chǎn)經(jīng)營職能的二級分支機構(gòu)，就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。
三、在何種情況下，二級分支機構(gòu)不需要就地分?jǐn)偅?/span>
滿足以下條件之一的不就地分?jǐn)偅?/span>
（一）不具有主體生產(chǎn)經(jīng)營職能，且在當(dāng)?shù)夭焕U納增值稅、營業(yè)稅的產(chǎn)品售后服務(wù)、內(nèi)部研發(fā)、倉儲等匯總納稅企業(yè)內(nèi)部輔助性的二級分支機構(gòu)，不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。
（二）上年度認(rèn)定為小型微利企業(yè)的，其二級分支機構(gòu)不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。
（三）新設(shè)立的二級分支機構(gòu)，設(shè)立當(dāng)年不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。
（四）當(dāng)年撤銷的二級分支機構(gòu)，自辦理注銷稅務(wù)登記之日所屬企業(yè)所得稅預(yù)繳期間起，不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。
（五）匯總納稅企業(yè)在中國境外設(shè)立的不具有法人資格的二級分支機構(gòu)，不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。
四、某二級分支機構(gòu)所在地主管稅務(wù)機關(guān)自行對該二級分支機構(gòu)實施稅務(wù)檢查，需要查補稅款（包括滯納金、罰款）。該如何處理？
二級分支機構(gòu)應(yīng)將查補所得稅款的50％分?jǐn)偨o總機構(gòu)繳納，50％分?jǐn)偨o該二級分支機構(gòu)就地辦理繳庫。
因此，該稅務(wù)檢查與其他二級分支機構(gòu)無關(guān)，只在實施稅務(wù)檢查的二級分支機構(gòu)和總機構(gòu)之間進行分?jǐn)偂?/span>
五、總機構(gòu)所在地主管稅務(wù)機關(guān)自行對總機構(gòu)實施稅務(wù)檢查，需要查補稅款（包括滯納金、罰款）。該如何處理？
總機構(gòu)應(yīng)將查補所得稅款的50％按照分?jǐn)偙壤?，分?jǐn)偨o各分支機構(gòu)（不包括不就地分?jǐn)偟姆种C構(gòu)）繳納；50％分?jǐn)偨o總機構(gòu)繳納。
因此，該稅務(wù)檢查不涉及不就地分?jǐn)偟姆种C構(gòu)，只在實施稅務(wù)檢查的總機構(gòu)與就地分?jǐn)偟亩壏种C構(gòu)之間進行分?jǐn)偂?/span>